专科论文查重的时候，参考文献算不算在查重范围内，这得分情况来说。一般来讲论文查重系统在查重的时候，会对参考文献做一定的处理。因为参考文献本身就是我们在写论文时参考借鉴的资料，正常引用是没问题的。

有的论文查重系统会把参考文献排除在查重范围之外。它能识别出哪些是参考文献，然后在计算重复率的时候，就不把这部分算进去。这样能更准确地反映论文正文的原创性。

但也有些情况，论文查重系统可能没法很好地区分参考文献和正文内容。这可能就会导致参考文献也被算进查重里了。如果参考文献的格式不正确，比如引用的标注不规范，或者排版混乱，查重系统可能就会误判，把它当成正文的一部分来查重。

还有就是，不同的学校或者老师对于查重的要求可能不太一样。有的可能明确要求参考文献也要查重，主要是为了检查学生有没有过度引用，或者引用的格式对不对。

所以说，专科论文查重是不是包括参考文献，没有一个绝对的答案。在写论文的时候，咱们为了保险起见，还是要认真对待参考文献的引用和格式。按照学校或者老师要求的规范来标注，把格式弄整齐了，这样能减少因为参考文献带来的查重问题。

如果对论文查重结果有疑问，或者不确定参考文献到底有没有被查重，最好跟老师或者学校的相关部门沟通一下，弄清楚具体的要求和规定。