论文查重的过程中，参考文献和附录部分的处理方式往往因学校和期刊的具体要求而有所不同。了解这些处理方式有助于在撰写和提交论文时确保其符合相关标准。

参考文献部分通常包含了论文中引用的所有来源。在很多情况下，参考文献被认为是论文中必不可少的一部分，虽然它们通常不被纳入查重计算的范围。查重工具一般会识别并排除这些内容，以避免将引用文献的重复计入到论文的重复率中。这种做法旨在确保对学术诚信的尊重，同时避免对那些标准的引用格式的惩罚。确保参考文献的格式正确、完整，能够减少因格式问题引起的不必要的重复率检测。

附录部分则情况稍微复杂一些。附录通常包括补充数据、详细的实验过程、额外的图表等，这些内容用于支持论文的主要部分。附录的处理在查重过程中通常取决于具体的查重工具和机构的规定。有些查重工具会将附录的内容包括在内，尤其是当附录中包含大量与主要内容重复的数据或描述时。其他工具可能会将附录部分排除在查重范围之外。附录的重复检查主要针对那些直接影响论文原创性和学术贡献的内容。如果附录中的数据或方法与已发表的文献有较大的重合，可能会被认为影响论文的整体独创性。

为了确保论文在查重过程中达到最佳效果，作者应当熟悉所提交学校或期刊的具体查重要求。一些机构可能会提供具体的指导，说明参考文献和附录部分是否会被纳入查重范围。如果有疑问，及时与相关部门沟通，获取准确的信息，可以避免因查重不合格而带来的问题。

此外，在撰写论文时，作者应特别注意在正文中进行恰当的引用，避免在参考文献和附录中出现与已发表内容过度重复的情况。尽量保持原创性，并在必要时进行适当的修改，以减少因查重引起的困扰。尽管参考文献和附录部分可能不总是直接影响查重结果，但良好的写作习惯和对引用规范的严格遵循，仍然是确保论文符合学术要求的重要步骤。

在论文的最终提交之前，使用可信的查重工具进行自检，可以帮助识别可能的问题区域，确保论文的重复率符合要求。这样，能够提高论文的接受率，同时也体现了对学术诚信的重视。了解和遵循这些标准，有助于作者在学术研究中保持高水平的原创性和贡献。