毕业论文查重的最佳时机并非固定不变，而是可以根据个人写作进度和学校要求来灵活安排。以下是几个建议的最佳查重时机：

初稿完成后：在完成毕业论文初稿后，进行自我审查和修改的过程中，就可以进行首次查重。此时查重有助于及时发现文章中的抄袭问题，以便有足够的时间进行修改和提升论文质量。

导师评阅前：在导师评阅之前进行查重也是明智的选择。如果学生在导师评阅前就能够将论文进行查重并做出相应修改，就可以避免导师提出的关于抄袭的批评和建议，从而提高论文的质量和通过率。

最终定稿前：在最终定稿之前再进行一次全面的查重，能够确保毕业论文的质量和学术诚信。这一步骤是不可或缺的，因为只有经过严格的自查和查重，学生才能保证自己的论文是原创的，符合学术规范，避免因抄袭问题而导致论文不被接受或遭受惩罚。

从学校安排的角度来看，大部分学校会在每年的某个时间段（如3月到6月）开放查重系统给学生使用，因此学生也可以计划好论文写作时间，留出足够的时间在学校提供的查重机会内进行查重和修改。

毕业论文查重的最佳时机应综合考虑个人写作进度、学校要求以及查重系统的开放时间。在初稿完成后、导师评阅前和最终定稿前进行查重，可以最大程度地确保论文的质量和原创性。