多次进行论文查重其实不会直接影响到论文的质量，但间接影响还是有的。论文查重本身是一个工具，用来帮助作者检查文章是否存在无意间的抄袭或是引用不当的问题。通过论文查重，作者可以及时发现并修正这些问题，从而提升论文的整体质量。

当一篇论文经过第一次论文查重后，如果发现有部分内容相似度过高，作者通常会采取一些措施去修改降低论文的相似度。比如，重新组织语言，用自己的话来表达原意，或者增加引号标注出直接引用的部分，并且给出正确的引用来源。

然而，如果过分依赖论文查重报告，频繁地修改论文以追求极低的相似度百分比，反而可能带来一些负面效果。比如，为了降低相似度而过度改写原文，可能会使论文的语言变得生硬、不通顺，甚至改变了原本的意思，影响了论文的可读性和逻辑性。另外，有时候为了达到查重要求，作者可能会删掉一些重要的参考文献或背景介绍，这样虽然降低了相似度，但却削弱了论文的理论基础和研究深度。

因此，论文查重应该被视为一个辅助工具，而不是写作的最终目标。合理使用查重工具，可以帮助作者更好地把握论文的原创性，但更重要的是要注重论文内容的真实性和创新性。在写作过程中，应当注重对研究主题的深入探讨，合理引用前人的研究成果，同时保持自己的独到见解。

另外，不同的期刊或会议对论文的相似度要求各不相同，有的可能要求非常严格，而有的则相对宽松。作者在投稿之前，应该仔细阅读目标期刊或会议的投稿指南，了解其具体要求。这样，在进行查重和修改时，就能更有针对性，既满足要求又不至于过度修改影响论文质量。